Trong suốt một thế kỷ rưỡi qua, cách giải thích phổ biến theo khuynh hướng phi Tin Lành (nonevangelical) về câu chuyện Nô-ê cho rằng đây không phải là một câu chuyện duy nhất, mà ít nhất là hai câu chuyện riêng biệt được ghép nối một cách vụng về nhằm tạo thành một tổng thể thống nhất. Bằng chứng được đưa ra cho sự tồn tại của hai câu chuyện gốc là việc Nô-ê trước hết được bảo đem lên tàu mỗi loài hai con, rồi sau đó lại bảo đem bảy con mỗi loài thanh sạch.

Trong kết luận cuối cùng, theo một học giả phê bình xuất sắc, chỉ có một bằng chứng duy nhất cho sự bất nhất của câu chuyện Nô-ê, đó là sự lặp lại hoặc sự xuất hiện nhiều lần. Ông lập luận rằng sự lặp lại đó không có ý nghĩa gì trừ khi hai hay nhiều tường thuật đã được hợp nhất với nhau.

Sự lặp lại đôi khi có thể là dấu hiệu của các truyền thống khác nhau và của một biên tập viên đã hàn gắn nhiều phiên bản của cùng một câu chuyện, hoặc thậm chí là các câu chuyện khác nhau lại với nhau. Nhưng cũng có những cách giải thích khác cho cùng hiện tượng này. Sự lặp lại là một trong những công cụ cơ bản nhất của người nghệ sĩ văn chương. Sự hiện diện của nó không nhất thiết chỉ ra rằng tác phẩm văn chương đó là một mớ hỗn độn được ghép nối phản ánh các yếu tố không đồng nhất từ nhiều nguồn hỗn hợp, dù là truyền khẩu hay văn bản.

Khẳng định rằng Sáng thế Ký 6:19–20 đến từ một nguồn Tế lễ (priestly source) vào khoảng năm 450 T.C. và Sáng thế Ký 7:2–3 đến từ một nguồn Yahwist (Yahwistic source) sớm hơn vào khoảng năm 850 T.C., là nói rằng biên tập viên đã để cho sự mâu thuẫn này tồn tại. Không cần thiết phải có những lý thuyết nguồn gốc xa hoa như vậy, đặc biệt khi chúng ta có một câu chuyện Đại hồng thủy từ thiên niên kỷ thứ hai T.C. từ Lưỡng Hà, là Sử thi Gilgamesh, với nhiều chi tiết tương tự. Sử thi Gilgamesh, chỉ mới được khai quật trong thế kỷ này, khó có thể đã kết hợp cái gọi là nguồn Tế lễ và nguồn Yahwist từ thế kỷ thứ năm và thứ chín T.C., vì nó đã được viết và chôn vùi từ lâu trước đó. Vậy tại sao chúng ta phải cho rằng sách Sáng thế Ký kết hợp những nguồn được cho là muộn hơn như vậy?

Sự thật là không có sự không tương thích nội tại nào giữa hai văn bản như chúng hiện đang tồn tại. Sáng thế Ký 7:2–3 chỉ chính xác hơn 6:19–20 về vấn đề chủng loại và số lượng các loài thú và chim sẽ lên tàu.

Chỉ thị đầu tiên của Nô-ê là đem các cặp của mọi loài sinh vật lên tàu để bảo tồn sự sống của chúng (Sáng thế Ký 6:19–20). Đó là công thức cơ bản. Sau đó, ông được ban cho những chỉ thị cụ thể hơn về việc đem bảy cặp mỗi loài thú thanh sạch và bảy cặp mỗi loài chim. Mục đích của biện pháp này sẽ chỉ trở nên rõ ràng sau trận lụt. Chim sẽ cần thiết để do thám mặt đất (Sáng thế Ký 8:7–12), và các loài thú thanh sạch cùng loài chim sẽ được dùng làm tế lễ dâng lên Chúa (Sáng thế Ký 8:20). Nếu Nô-ê chỉ đem mỗi loài một cặp và rồi dâng mỗi cặp đó làm tế lễ, thì các loài đó sẽ bị tuyệt chủng hoàn toàn.

Cách giải thích đơn giản nhất và thỏa đáng nhất là Sáng thế Ký chương 6 chứa các chỉ dẫn tổng quát — hãy đem mỗi loài hai con. Sau khi Nô-ê đã hiểu những chỉ thị tổng quát này, Đức Chúa Trời đã phán cụ thể hơn về vai trò mà các loài thú và chim thanh sạch sẽ đảm nhận.

Kinh Thánh không cho biết sự phân biệt giữa “thanh sạch” và “không thanh sạch” phát sinh từ đâu. Về sau, luật Môi-se sẽ công nhận sự phân biệt này và định nghĩa nó một cách chính thức. Nhưng chúng ta vẫn không có bất kỳ dấu hiệu nào về nguồn gốc của sự phân biệt này, cũng như chúng ta bị bỏ mặc trong bóng tối về việc làm thế nào và khi nào toàn bộ ý tưởng về tế lễ bắt đầu. Ca-in và A-bên đều dâng tế lễ, nhưng không có một tuyên bố chính thức nào ghi lại việc khởi xướng nghi thức này.

Nếu một số nhà phân tích vẫn muốn loại bỏ các loài thú thanh sạch khỏi cái gọi là tường thuật Tế lễ của câu chuyện Đại hồng thủy trong Sáng thế Ký, họ chỉ đang đưa vào cái mà họ gọi là tường thuật Yahwist chính xác loại lặp lại mà họ trước đó đã coi là dấu hiệu của các nguồn khác nhau. Đó là một cái giá quá đắt phải trả chỉ để tránh thừa nhận rằng có lẽ các tường thuật về việc các cặp thú không thanh sạch lên tàu được kết nối với việc các cặp thú thanh sạch lên tàu. Sáng thế Ký 7:6–15 không ủng hộ cách giải thích theo nguồn Yahwist và nguồn Tế lễ; thực tế, nó gây ra những rắc rối bất thường cho cách phân tích tài liệu như vậy.